El curso de Maestría en Química con sus líneas de investigación en Química Analítica, Química Inorgánica, Química Orgánica y Fisicoquímica, y el curso de Doctorado en Química Analítica y Química Orgánica, tienen como objetivo la formación de investigadores de alto nivel en su área de investigación. En ese sentido, es proporcionado fundamentalmente una sólida formación metodológica, desarrollando en los estudiantes la capacidad de investigar y aplicar los conocimientos científicos adquiridos.
La misión de los cursos de Maestría y Doctorado es desarrollar la investigación básica y aplicada en los diferentes campos de la Química, con el objetivo de integrar las necesidades del parque industrial y la sociedad, estudiando las reacciones químicas en laboratorio y en el medio ambiente.